¿Big Data para predecir variantes de covid?

Se trata de acumular un máximo de datos para poder predecir comportamientos o fenómenos y así poder prepararnos con antelación. Él Inteligencia artificial (IA) y el grandes datos ya son imprescindibles en el análisis y seguimiento de una pandemia como la vivida. Sirva de entrenamiento porque todo indica que serán mucho más en los que vendrán.

“Por ejemplo, Pfizer tiene lo que se necesita para predecir variantes. Un sistema que predijo 12 de las 13 variantes de interés semanas antes del aviso de la Organización Mundial de la Salud (OMS). En cualquier caso, habrá que ver si ahora es válido. Tiene una parte de inteligencia artificial (AI). Se basa en el seguimiento de secuencias que pasa a estar disponible en la base de datos GISAID (una base de datos internacional donde se comparten datos genómicos del virus de la gripe y del SARS-CoV-2), que es otro buen ejemplo de la era del Big Data, en este caso de la viral. secuencia. Hay un análisis muy accesible de este sistema en ‘Fortune’”, dice Daniel González-Peñaingeniero informático y profesor e investigador en bioinformática en la Universidad de Vigo (UVigo).

De todas formas, Los expertos llaman a la cautela: aseguran que aún es pronto. “La IA y los sistemas de modelado se pueden usar principalmente para la selección antigénica. Ya se ha utilizado en la gripe, por ejemplo. Utilizando modelos de IA, se determinan las variantes de antígenos circulantes; que tienen una mayor cobertura de variantes en circulación”, expresa Federico Martinón, jefe de pediatría del CHUS y experto en vacunación. “También existen sistemas de modelado que intentan anticipar o predecir las próximas variantes. De todos modos, estos son modelos; la interpretación debe ser cautelosa. Hasta la fecha no han sido útiles en el contexto del SARS-CoV-2”, agrega el especialista. Según Martinón, “no lograron predecir futuras variantes, pero para la selección antigénica sí”.

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Para África González, profesor de inmunología: “Es difícil predecir qué pasará con la IA por la gran cantidad de posibles variaciones que pueden existir en un mismo patógeno. Es una herramienta muy poderosa, pero en última instancia, la selección natural hace que algunas variantes se desarrollen más que otras. Variantes que surgen a diario, pero muchas desaparecen rápidamente sin mayores consecuencias”.

Según este experto, los algoritmos de predicción “son mucho más complejos que simplemente ver si el patógeno muta en cada posición, porque en muchos casos este virus en concreto puede tener ventaja sobre otros”.

Tal y como apunta Daniel González-Peña, un artículo de Harvard Business Review explica por qué la IA no ha logrado liberar todo su potencial durante la pandemia (Por qué la IA no ha estado a la altura de su potencial durante la pandemia, en www.hbr.org). para este especialista es muy utilizado y su papel es clave en la secuenciación del virus, a través de la base de datos GISAID. “Se ve mucho movimiento en la ‘academia’, a nivel científico, pero siento que poco de ese movimiento se acaba trasladando a la vida real (en este campo y en casi todos los campos, porque, d por otro lado , es lógico en el mundo de la investigación), especifica Daniel González, quien indica que, por el momento, La IA no ayuda a predecir ni guiar la toma de decisiones en COVID. “La IA no se usó para predecir una ola precisa”, agrega.

evolución del virus

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Respecto a la evolución del virus ahora, tras dos años de pandemia, África González dice que es “difícil e improbable” que surjan variantes mortales. “La vacunación y la infección, o ambas, significan que nuestro sistema inmunológico ya ha visto el virus y siempre responderemos mejor a las nuevas variantes que puedan llegar. El problema inicial era que se trataba de un virus nuevo para todos, expresa el inmunólogo, que añade: “Los grupos vulnerables son aquellos que, si se infectan, pueden desarrollar una enfermedad grave”. “Por eso, las medidas futuras deben estar dirigidas a ellos. Además de la revacunación, existen antivirales y anticuerpos monoclonales que también pueden ayudar”, dice.

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¿La evolución del virus? “No sabemos cómo puede evolucionar. Sabemos cómo han evolucionado otros seres queridos de tu familia, los coronavirus estacionales, la duración de la protección es limitada en el tiempo y siguen evolucionando. Forman parte de ese panel de virus endémicos estacionales”, describe Martinón. Y añade: “Sin embargo, no sólo se vuelve endémica estacionalmente, sino que pierde su virulencia. En el caso de omicron, se ha perdido cierto grado de virulencia respecto a variantes anteriores, pero no tenemos garantía de que así sea. La evolución del SARS-CoV-2 no es lineal, omicron no es la próxima variante delta. Omicron es antigénicamente muy diferente a los anteriores. El siguiente puede ser filogenéticamente más cercano a los anteriores o diferente. No hay forma de saberlo. Estamos en otra fase de la pandemia pero no todo está hecho; El seguimiento molecular del virus tanto en humanos como a nivel animal y ambiental es fundamental”, subraya Martinón.

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